转录和**表型分析揭示结直肠癌

在结直肠癌(CRC)的发展中，腺瘤-癌序列的范例通常集中在癌细胞上；然而，现在清楚的是，癌症进展涉及转化细胞与其周围微环境之间的异源相互作用。到目前为止，大多数研究都依赖于结直肠癌晚期的批量图谱来识别癌症驱动基因并定义与癌症相关的生物学过程。

近日，来自莱顿大学医学院病理学系的研究者们在Gut杂志上发表了题为“Transcriptomic and immunophenotypic profiling reveals molecular and immunological hallmarks of colorectal cancer tumourigenesis”的文章，该研究揭示了早期结直肠癌肿瘤发生的分子和**学景观。研究者确定了与**进展密切相关的生物标志物，以及可在临床环境中利用的有针对性的**过程。

对结直肠癌(CRC)的逐步发展和进展的生物学洞察对于开发针对这种**的早期发现和*佳临床处理的量身定制的方法是必不可少的。在本研究中，研究者的目标是剖析伴随着结直肠癌恶变的转录和**学改变，并通过对PT1结直肠癌样本的空间图谱来识别临床相关的生物标记物。

研究者在8个PT1癌组织上使用数字空间图谱(GeoMx)来研究不同组织学区域的上皮和间质节段的基因表达，包括正常黏膜、低度和高度不典型增生和癌。连续的组织切片通过成像质量细胞仪进行分析，以揭示**环境。*后，对公开获得的单细胞RNA测序数据进行分析，以确定相关转录本的细胞来源。

对PT1结直肠癌样本中不同区域的基因表达的比较发现，在不同的组织结构中，差异表达的基因在上皮(n=1394个基因)和间质段(n=1145个基因)中。通路分析发现，在恶性转化过程中，炎症反应较早发生，典型的表现为基因信号上调，如先天**感应。

研究者检测到骨髓细胞浸润增加，巨噬细胞通过发育**从正常组织向癌症转移，从亲炎症的HLA- DR+CD204 -巨噬细胞向HLA- DR - CD204+**抑制亚群转移，同时CD47/ SIRPα“不吃我信号”上调。

总之，这项研究展示了数字空间剖面图在早期结直肠癌中的应用，并对伴随结直肠癌逐步进展的生物学过程提供了见解。本研究的结果表明先天**在结直肠癌发病中起着重要作用。此外，该研究的方法提供了一个框架，用于识别在结直肠癌发生过程中持续变化的生物标记物。这些见解为改善早期结直肠癌患者的临床管理铺平了道路。（生物谷 Bioon.com）